Outro programa que segue a mesma linha é o Programa de Financiamento Estudantil, o FIES, destinado a financiar a graduação de estudantes que não têm condições de arcar com os custos de sua formação e estejam matriculados em instituições não gratuitas, cadastradas no Programa e com avaliação positiva nos processos conduzidos pelo MEC.
Porém, há uma diferença: no final do curso, o estudante deve devolver o dinheiro à instituição. Para conseguir a bolsa, é entrar com o pedido e mandar seus dados financeiros. A partir desses dados, eles decidem se a bolsa será de 25%, 50% ou 75%.
Criado em 1999, a partir de 2005, financiamento aos estudantes selecionados pelo ProUni para recebimento da bolsa de 50%. O FIES pode ser utilizado por estes estudantes para pagamento de 25% do valor da mensalidade. Funciona assim: alguns jovens, com sua pontuação do ENEM, conseguem bolsas parciais de 50% pelo ProUni.
