A avaliação é feita em diferentes áreas anualmente, formando um ciclo. Quase todas as médias dos alunos que fizeram as provas ficaram abaixo de 50, numa escala de zero a cem. Mais de 380 mil estudantes participaram do exame.
O exame do Enade 2006 foi aplicado no dia 12 de novembro de 2006 e os cursos avaliadas foram: administração, arquivologia, biblioteconomia, biomedicina, ciências contábeis, ciências econômicas, comunicação social, design, direito, formação de professores, música, psicologia, secretariado executivo, teatro e turismo. Os alunos de arquivologia conseguiram a melhor média, com 50,7. A menor média foi do curso de administração, com 42,1.
